北路、中路合兵后，进展颇为顺利。
副将马良柱率领的南路开始颇称顺利，此时却出了问题。
他从南边的里塘境内向瞻对进兵，路上需要攻克的关隘多在高山之上。冬季，大雪封山，“因雪阻粮运维艰”，进攻几乎停顿。更要紧的是，他一路分兵镇守攻克的要口关隘，已感兵力吃紧，这时，由西藏地方政府派来领兵助战的台吉冷宗鼐声称生病需要医治将养，不待马良柱允准，便擅自离任，回金沙江西边他的原驻防地江卡去了。大家应该记得江卡这个地方，就是在此地驻防的清兵回川途中被瞻对夹坝抢劫，方才引起这场战事。冷宗鼐所带藏兵纪律松弛，见长官冷宗鼐离岗，也各自上路回家，作鸟兽散了。这些藏兵，虽不堪大用，但至少可以防守后路，他们的离去，使马良柱用兵更感捉襟见肘，以至于裹足不前了。
西藏此股兵力，与随官军出征的瓦寺、杂谷、章谷、麻书、孔萨、德格等土司辖下土兵不同。各土司均属四川直接辖制，而擅自散去的这一股藏兵，却是属于西藏地方政府管辖。因此在长长的驿道上，文书来往，又起了一场笔墨官司。
此事先由庆复上奏皇帝：“西藏台吉冷宗鼐带领江卡土兵协攻番贼，甚为出力。”这是套路，先扬后抑。“嗣因冷宗鼐回卡养病，而土兵等亦各散归。殊违功令。现咨驻藏都统饬知郡王颇罗鼐将为首倡回之土兵惩治。又闻冷宗鼐回至江卡，因各土兵已回，随另派兵前往更换。如果前赴军营，未便阻其悔过报效之心，应听在营效用。”
那时，西藏延至后世的以达赖喇嘛为首的政教合一的噶厦政府并未创立，行政权力由世俗贵族（郡王）掌控。此时的郡王是忠于清廷的颇罗鼐。这位在江卡领兵的冷宗鼐就是他的部下。所以，庆复要求皇帝令颇罗鼐惩治其部下。
对此，皇帝也未便立即表态，只说，知道了，已经降旨于郡王颇罗鼐。
不久，西藏方面对此有了回复。
不是西藏郡王颇罗鼐直接回复，而是通过驻藏大臣傅清上奏：“郡王颇罗鼐详报，前因总督咨称冷宗鼐在彼纵酒妄为，理宜严行训饬。曾将冷宗鼐所领兵丁著宰桑讷亲等管理，令其回藏。”
原来，冷宗鼐擅自离岗前，前线统兵官就已对他不满，向上反映过他纵酒妄为的行为了。而且这意见也转到了西藏方面。颇罗鼐也采取了相应措施，即另派了名叫讷亲的前去替换，代行其职。
但是，“兹据讷亲等报称，冷宗鼐不肯交付兵丁，自己回去，兵丁亦皆跟随回去”。
原来，这位指挥官请病假是闹情绪，从古至今，官员无论大小，无论汉夷，很多时候，生病与休病假，都与身体状况无关。
“冷宗鼐为人糊涂，恐于事无益，前已禀明，今闻伊所领兵丁回来，不胜惶恐之至。颇罗鼐虽系微末之人，蒙主上加恩封为郡王，凡事敢不奋勉。……倘该大臣等具奏系因吾言致冷宗鼐带兵回去，颇罗鼐实无生路，不胜惶恐。冷宗鼐又系奏派之人，恳请奏闻将冷宗鼐正法。”
看来庆复等四川方面大员还有奏折上告，冷宗鼐离岗是受了郡王颇罗鼐之命，这在乾隆皇帝谕旨中也得到证实。皇帝说，“近据总督庆复等奏闻郡王颇罗鼐将冷宗鼐调回，伊所领兵丁亦皆相继回去一折，朕以颇罗鼐诸事甚属谨慎，即此次除派往瞻对兵丁外，复派伊素所信任曾经行阵之宰桑等前往，无非在感戴朕恩，输诚效力。今将冷宗鼐调回，系酌量于行事有益。兵丁等皆系冷宗鼐带往之人，边地番民不知法纪，因伊首领回去，亦一同随往耳。是以朕特未降旨，只谕令大臣等将总督等所奏晓谕使臣，令伊回去告知颇罗鼐，所有兵丁回去，并非伊之指使，朕早已洞鉴矣。今观颇罗鼐所云，若具奏江卡兵丁因伊言回去，伊竟无生路，不胜惶恐之语，朕心愈加轸念。着将朕从前办理缘由，札寄副都统傅清，传旨明白晓谕。再，据颇罗鼐所奏，冷宗鼐为人甚属糊涂，现犯军法，著交大臣等议罪，候朕降旨，将此一并晓谕颇罗鼐知之。”
在这件事情上，皇帝与庆复等人只讲军事不同，他讲的是政治。那时，西藏初定，郡王颇罗鼐对朝廷颇为忠顺，皇帝自然不会因了藏官违反军纪，便严刑峻法，而使藏方生出疏离之心。但在庆复等前线指挥看来，一个军官，擅离军阵，这就是杀头之罪。皇帝安抚了因此情绪紧张的西藏郡王，转而还要给需要严肃阵前军纪的领兵大员们一个交代。于是，便把这冷宗鼐如何处置的问题，交给身边行走的大学士等，说，你们议一议，拿一个两全其美的方案。
但这些大员也未摸透皇帝的心思，属于搞政治而不懂政治的人。他们的意见：“应将冷宗鼐照该王颇罗鼐所请，即行处斩，以为违反军令者戒”，“至冷宗鼐所属兵丁”，“请咨行驻藏副都统傅清饬交郡王颇罗鼐严查究办”。
皇帝终于只好直接表达自己的意见：“前经总督庆复奏称，冷宗鼐初到军前，尚属效力。今据颇罗鼐奏伊糊涂，酒后妄为，恐在军前于事无补，令伊换回。伊并不遵颇罗鼐所谕交付讷亲兵丁，即行回程。盖因愚鲁无知，以致获罪。其情尚属可矜。著施恩免其处斩，交颇罗鼐酌加惩处。余依议。”其他那些兵丁，反正也不致杀头之罪，就按你们说的办吧。
今天，常从各级行政机构人员口中听到一句话，西藏无小事，藏区无小事，恐怕这种感觉从乾隆朝时就开始了吧。