虽然展开追击，武田信玄的本队和后备穴山信君队仍然按兵不动，似乎是为了保持战力。不久，信玄的本队终于移师，穴山信君队也跟随在后。
来到追分，信玄令各队点灯行进。
这是为了让敌军知道本队和后备队的存在。
二万名武田军投入追击战，另外还保存了一万兵力。或许，这就是他想要夸示的。
到了小豆饼，后备穴山信君奉令兵分二队，在本队前方左右展开。
不久，穴山全体队员接到命令：
“我军不久便会撤退。让撤退回来的部队调到后备。”
信玄已经想妥了收兵之策。如果不好好收回前去追击的武田军，则极可能遭到敌人的反击。故点灯明示本队所在之地。
武田队的灯火在三方原上一片光亮。从滨松城看去，武田军似乎又展开攻击；在追罢归来的武田兵眼中，则如展臂迎子的母亲怀抱。伤兵顺着灯火，陆续归队。追击队似乎仍想追敌，无意撤回。
信玄在小豆饼和犀崖中间停下，让主队准备过夜。穴山信君队则继续前进，负责看守面对犀崖的地带。
犀崖桥旁燃着熊熊营火。
下令撤退的洋枪队，连续射击五次。片刻后，又射五次，隔一阵子后，再射五次。枪声在暗夜中回荡。
追到滨松城附近的追击队，由于中途各自分散，无法紧追着德川军进城。跟进城，需要二、三千人的部队一次拥入，而后紧紧跟入。
黄昏时分，三方原之战无法再进行。如果战争在早晨展开，武田军必可一口气攻下。但是，黑夜阻挠了一切。黑暗中，误打误撞地来到城下，当然无法进入城内。
在洋枪队发出撤退信号的同时，追击队朝各地的营火退回。德川军并无反扑的态势。
各队开始点名，照料伤患，准备晚餐。营火照耀下的首级，有时会发生竟是同伴首级的悲剧。
各队放出步哨警戒。
“敌军必定会派出小部队趁夜偷袭，各队要小心警戒。”
夜袭时尤其须谨防同伴在混乱中自相残杀。
各队一半睡觉，一半负责警戒。
事实上，在野风呼呼的原野上岂能安睡？士兵们轮流去取柴火，尽量在营火旁休息。有人拿出饼烧烤，也有的人不知从那里弄来的锅，放在火上，加水煮杂食来吃。
士兵的情绪依然激动，无暇闲聊当天的功绩。只要远处一有枪声，便立即摆出警戒姿态。
夜袭确实如预料中出现，只是规模不大。德川军的洋枪队向在最前线的穴山信君队射击。穴山队的步哨遭到袭击，仅此而已。滨松城内一片混乱，还不到反扑的时候。刚遭败绩的他们必须思索如何防备即将于天明后来袭的武田队。
约二千人没有回城。万一他们全部阵亡，则是四比一的状况。目前实在无暇反扑。
根据《当代记》的记载，德川军和平手泛秀军共有千人被诛，其中有多少德川军，则不得而知。
无法于当夜回滨松城的将士，在次日武田军离开城下后，陆续归来。由于武田军的追击行动快迅，许多人不及入城，逃往四方。
《松平记》记载道：上方浪人中河等人逃到挂川，家康的谱代家仆山田半一郎逃到冈崎。
家康本营中的大将榊原康政，也在中途和家康等人走散，和数名骑兵逃到滨松东方的西岛过夜。
许多被武田军逼散而被迫于某地过夜的德川军，在天亮后陆续回城，人数不少。
滨松城内的妇女们炊煮粥食，慰劳归来的将士。被诛者达千人，负伤者更是三倍以上。照顾工作十分繁重。
对德川军而言，这是一场彻底的败仗。经过这一仗德川家康对武田军敬畏万分。信玄死后，胜赖率大军前来挑战时，德川军不敢单独应战，对决多日后，才联合织田军在设乐原与武田胜赖军交战。
信长在本能寺被杀时，德川家康正在堺港。家康逃脱明智光秀之手，回到冈崎之后，首先出兵甲斐国，目的在驱逐信长旧臣，夺回甲斐。对于残存下来的武田信玄的旧臣则极力吸收，以增加自己的实力。
三方原的痛苦经验，给家康一个很大的教训。
《甲阳军监》对三方原之战做了下列记述。
马场美浓守信春认为，年三十一的大将家康，是全日本继越后上杉谦信之后的大将。细看三方原之战中战死的三河武士，无一人朝武田军方向倒下，皆是俯向，而朝滨松城倒下的士兵，大多是仰向。论及高傲的武士精神，则非上杉谦信和德川家康莫属。
最后一段的记述，出自《甲阳军监》作者小幡景宪之笔，主要在说明：
（德川军之阵亡者，无一见背于敌军。）
德川家康和上杉谦信皆被尊奉为日本第一大将，而三河武士精神尤被视为日本之最。歌颂德川家康的书籍，大多在德川时代的太平盛世出版，自然成为畅销书。
小幡景宪夸张的记述，经常被其他出版物引用，甚至有不少这样的俗书：
（武田信玄见三河武士无一人背向而死，心存恐惧，便下令停止攻击，退至刑部。）
就连史书中，也有不少类似这样的书籍。
《甲阳军监》把三河武士形容成武士之最，但是相对的，《当代记》中则记载家康的谱代家仆山田半一郎逃到冈崎。山田半一郎仅是逃亡者的代表，实际人数自然是无从计算。
战败时的逃脱行为，乃人之常情。但是，德川旗下的夏目次郎左卫门和青山又四郎、中根正昭等人的为主公牺牲，确是真人真事。《甲阳军监》中提到的武士精神，所指的应该是这些人吧！
在三方原上战死的德川名将（中队长、小队长级），有青山又四郎、中根正昭、夏目次郎左卫门、鸟居忠广、本多忠真和米津政信等人。分队长级的人数更是可观，在此无法一一赘述。大将（大队长）级的战死者，只有平手泛秀一人。
武田军方面当然也有伤亡，但是没有记录，可能是因为损失不大。
夜，逐渐泛白。武田军整理各队队伍，扫荡附近残敌。说是扫荡残敌，其实是想捕捉无法动弹的伤兵。武田兵充分运用仅有的一刻（二小时），搜索三方原一带。
在一刻内，捕得数十人，大多是伤兵，有些人在被带往武田营地的路上断了气。
被捕的伤兵受到照顾和饮食供应。
这时候，武田营内充满了生气。因为，统帅武田信玄就要检视首级了。其实，捕获的首级有上千个，自然无法在信玄面前一一展示。
在三方原之战中领导军团的大将，诸如山县昌景、小山田信茂、马场信春、武田胜赖、内藤昌丰等人，负责检视首级。较有名气的首级，才会被带到武田信玄面前。
在检视首级的现场，除了亲武田的三河山家三方众之外，还有俘虏以证人的身分参加。
在互报姓名下战死的人，有姓名可登记。在混乱中取得的首级，若无第三者的证言，便无法辨明究竟是谁的首级。这时，就需要俘虏的证言。
大多数的首级，是在追击战中获得，而其中又有不少是在二、三人围攻一个敌人的状况下获得，争功之事也随之产生。在这种情况下，一般而言，功劳是由最先举枪（或下手）的人所有。但是，黑暗中的追击战，很难分出究竟是谁下的手。在三人围攻一敌时，谁都坚持自己是最先出枪的人，不肯相让。三人所言均属实，黑暗中，看不到他人之举，只能相信自己的感觉。
争功之事，暂时搁置，先谈在首级册上记下被杀的敌人姓名，以及立功者的姓名。
慨然让功者，也是大有人在。这种人虽然被嗤为毫无欲望，但仍能若无其事地表示：战争还在继续，仍有机会可以立功。
立大功者，在被记下功勋时，兴奋得满颊通红。想到即将得到的恩赏，不觉陶然。
约五十个首级以及立功者，被带到武田信玄面前。
山县昌景在信玄身边对首级和立功者加以说明。
信玄频频点头，并向立功者称赞道：
“了不起。”
“不愧是个武士。”
被夸赞的人感到全身发热，赶忙行礼，久久不敢起身。在武田兵的心中，信玄有如神只。能直接被神夸耀，是莫大的光荣。
高间雄斋悄然。昨夜他已经知道那不是德川家康的首级，但总希望是榊原康政、本多康重、石川数正或酒井忠次等家老级的首级。可是，经俘虏证明后，才知道那是夏目次郎左卫门的首级。高间雄斋顿时像泄了气的皮球。
信玄对高间雄斋说道：
“虽然不是家康公的首级，但是此人自报家康之名，则无异是砍下家康的首级。如此之功，才是不凡。”
被这么称赞，雄斋反而退缩了。
此后，高间雄斋有了一个浑名，即是伪首雄斋。对他而言，那不是件光荣的事。
检视首级时，探子陆续回来，向山县昌景报告滨松城附近的敌人动静。
“走失的武士陆续回滨松城。城内时时放出探子但并无战意。”
信玄和山县昌景同时听取探子的报告，频频点头。
首级检视完毕。
胜利的仪式热闹非凡。
仪式中的大刀护卫，封给此次战役中立功最大者小山田信茂；弓箭护卫，则封给负责领先带路的三河山家三方众的代表——作手的奥平贞胜。
三万军队的欢呼声，几乎传到了滨松城。
仪式结束，首级分数处埋葬，由军僧祭悼。
此时，先锋队已先行出发，在祝田到刑部的路上保持警戒。
出发的信号响了。
部队以纵队方式堂堂出发。这是一个万里无云的寒冬早晨。昨日午后的那一场雪，依然残存着，当太阳升起时，大地闪烁辉耀。一点儿风都没有。
三方原依然平静，彷佛昨天黄昏时刻的厮杀根本不曾发生过。
信玄骑着马，旁边护以一、二十层的侍从，悠然前行。
大多数的人都相信那个骑在马上的人，就是统帅武田信玄。
但是，马上的信玄并非信玄，而是影子替身。检视首级时的信玄，也是替身。
信玄病了。
生病的信玄，在替身后方的轿子中。轿子共有三顶，其中二顶坐的是叡山的高僧。
信玄善用各种宗教。他尊重信仰自由，对任何宗教从不吝于援助。在西上之战带着亡命中的叡山僧，是为了在进京都时善加运用。但是，表面上是为了复兴被信长烧毁的叡山。
轿内坐的是被信长追逐而投靠信玄的叡山正觉院僧正豪盛、叡山满盛院权僧正亮信。第三顶轿子内坐的，便是卧病的信玄。
从合代岛出发的那个早上，信玄就受了点风寒。重臣们关心信玄的身体，提议乘轿，但是被信玄拒绝了：
“诱出德川家康的这一场战争，将是十分艰难。若是身为统帅的我坐在轿子内，这一场战争还能打吗？”
一整天，信玄在寒风中来回奔波。即使是夜间追击战，信玄也在主营中指挥。天空露白后，虽然不必再担心德川方面的反扑，但是信玄也倒下了。重臣们把信玄扶入轿中。轿子虽然能挡风，但是却没有火炉可以取暖，只能以层层的衣物保暖，体内热度愈来愈高。
信玄说自己感冒了。
重臣们都不相信。包括信玄自己在内，大家都担心这热度和肺痨有关。
若在西上的途中发病，如何是好呢？
轿夫们都认为第三顶轿子乘坐的是叡山天台宗的座主觉恕。这位伟大的僧人着了凉，在轿内休息。因为是伟大的僧人，所以警戒特别森严。其实天台宗座主觉恕，由于年事已高，无法同行。
当轿中的高僧唤人时，轿子立即停下，轿夫们被遣到远处。轿夫不明白为何要这么做。
武田军下了祝田坂便往西行，沿着都田川的河道，朝刑部而去。
祝田到刑部，约一里的路程。正午前，全军抵达刑部，在可以俯视都田川的台地上扎营休息。
刑部，又称油田。隔着都田川，对岸有气贺町和堀川的城堡，没有敌踪。
从滨松城到刑部的直线距离约三里。刑部位在三方原台地的西北端。
武田军在距离滨松城三里处扎营，是表示放弃滨松城，准备入侵三河。其实，他们还在窥视滨松城。
收集探子打听来的情报后，滨松城内展开了军事会议。
“武田军一定在使诈。”
“我们不可冒然出击。”
“不妨再观察一阵子。”
慎重派居压倒性的胜利。
只有本多忠胜持强硬态度，但是没有人支持。
“敌军此刻正被胜利冲昏了头，只要我们聚集精锐部队突击敌阵，必能擒获信玄公的首级。”
最后，家康向全军下达命令做结论。
“今后，没有命令擅自出城对敌者，一律以军法处置。”
德川军把武田军的停滞视为一种策略。其实，是因为统帅武田信玄发烧。
信玄的休息处，决定在刑部小山丘上的大圆寺。寺里的僧人全部被遣开，周围施以严密的警戒。对外则宣称，叡山曼珠院门迹天台宗座主的觉恕大僧正，住在大圆寺。
信玄的部队在台地，由替身坐镇。
徵集三万大军的食粮、燃料，真是一件令人头痛的事。
由于敌军随时可能来袭，因而特别加强巡逻和侦察。
潜入刑部的德川间谍越过严密的警戒网，带回报告：
“叡山天台宗座主，住在刑部大圆寺。”
“他把亡命中的叡山觉恕大僧正也带来了？”家康说道。
家康将此事告知信长，表示信玄进京的企图已毋庸置疑。
信玄的感冒并不单纯，而是引发出最令人担心的肺痨。发烧时，便会咯血。侍医御宿监物曾要求重臣们让信玄绝对保持平静。
但是，正在西上途中的信玄如何能平静下来？他满脑子想的全是西上策略。由于有太多的事前准备工作，因此他屡屡把山县昌景叫到床边，面授机宜。
在刑部滞留的这一段期间，派到各地的使者，不计其数。
信玄将三方原的捷报，通报各国武将。朝仓义景、浅井长政、本愿寺光佐、松永久秀等同盟军的将领，是最先得到通知的。采取观望态度的各将领，也没有被遗漏。就连远处的毛利家，也得到了消息。将军足利义昭得知三方原之战的详细报告后，立即想到信玄可能会率领大军进京，扫除信长的势力。
反应立刻到了。祝贺的信函如雪片般飞来。信长的处境愈来愈难了。
其中只有一封信不太令人满意。那是朝仓义景的来函。
三方原之役，可喜可贺。我等共同敌人，指日可灭。然我军自出援北近江小谷城以来，已有半年。将士疲倦不堪，严寒中又缺装备，故有意撤兵，待他日重整军备，再挥师齐制仇敌。
信玄在病床上阅读此信，愤怒不已。他唤来山县昌景，令其会同替身促使者传话之外，尚修书一封，措词激烈：
来函悉知。长期对阵，将士辛劳，可敬可佩。但将士虽疲，信长军亦同。信长之股肱家康受击，二千援军亦溃不成军，此乃迫敌之大好时机，阁下安能弃战返国？此无异违背承诺，陷我等于不利，使敌有机可趁。阁下之行动，实在令人费解。请速归队，协力包围信长。谨此重申，盼勿违约。
将士长期对阵的疲倦，不是促使朝仓义景突然退兵的主因，而是织田信长利用上杉谦信的计策奏效了。
信长频频赠舶来品给上杉谦信，最后还答应从西洋弄来南蛮屏风上的西洋马相赠。待抓住谦信的心之后，便提出这样的要求：
（朝仓义景如果不退，我们便不好着手弄马。想办法让朝仓义景撤兵吧！）
这只是表面上的协议，当然不乏更详细的交涉。
武田信玄是上杉谦信的宿敌。信玄进京取得天下，对谦信绝无好处。但是，势力急骤扩张而成为当今天下第一人的信长，对谦信也是一种威胁。
谦信不是那种会被一、二个南蛮屏风诱骗之人，当然也不会听从信长所言，让朝仓义景撤兵。
信长派使者到越后的谦信处。
（黄金，是促使朝仓义景撤离小谷城的最速手段，但并非由我方赠金。上杉家若以金三驮赠朝仓家，则必能促其撤离小谷。盼阁下能从中斡旋。若蒙垂首，除三驮黄金之外，另送上洋枪二百挺做为酬谢。）
这一项交涉，乃在是年十月初，信玄的西上军出发之后。
谦信终于采取行动了。当时，谦信和朝仓义景之间的关系良好，并无利害冲突。
十一月底，信长以海路将黄金和洋枪送往谦信处。
谦信把金货三驮送给朝仓义景，做为撤离北近江的费用。
朝仓义景因数度出兵，财政上已见短绌。他并不像信长那般拥有自由贸易都市，或有稳固的经济基础。
朝仓义景受黄金之诱退下阵来。信长的危机迎刃而解，回岐阜整军。
信长用金钱买到了胜利，往后，他经常使用这一招。高天神城被武田胜赖大军包围时，家康促信长基于盟约出兵相助，但是信长见死不救。家康愤怒极了。信长送上黄金二驮做为失去高天神城的慰问金，平息了家康的怒气。
信长以黄金为武器，使朝仓义景变节，影响了武田信玄的西上作战计划。