1872年（明治五年）
五月二日出生于东京府第二大区一小区内幸町二丁目（现东京都千代田区）一番的下层官吏之家。父亲名樋口则义，母亲名多喜，是家中次女，本名夏子或奈津。父亲原是山梨县的一名农民，安政四年离开故里，明治维新后来到东京府就职。樋口一叶此时已有一个姐姐和两个兄弟，之后父母又生下妹妹邦子。八月，举家搬迁至第五大区四小区下谷的樱井重兵卫方。
1873年（明治六年） 一岁
父亲兼任东京府权中属的教部省权大讲义。
1874年（明治七年） 两岁
二月，搬家到第二大区六小区麻布（现港区）三河台町五番。
九月，父亲任东京府中属。
1876年（明治九年） 四岁
四月，搬迁到第四大区七小区（现文京区）本乡六丁目五番地。
十二月，父亲于东京府中属退职。
1877年（明治十年） 五岁
三月，进入本乡学校上学；月末，因母亲反对被迫退学。十二月，父亲受雇于警视局，此时，一叶进入本乡町四丁目的私立吉川学校学习。
1878年（明治十一年） 六岁
六月，一叶来到吉川学校下等小学第八级（明治五年规定小学八年制，第八级相当于中国小学一年级）进修，七年级退学。其间在此学习草双纸。
1880年（明治十三年） 八岁
一叶跟友人松永政爱的太太学习裁缝。
1881年（明治十四年） 九岁
三月，父亲正式就职于警视厅。七月，搬家到下谷区御徒町三丁目三三番地。十一月，转入私立青海学校。
1883年（明治十六年） 十一岁
十二月，一叶以青海学校小学高等科第四级第一名的优异成绩毕业，没有继续下一阶段学习，然后退学。
1884年（明治十七年） 十二岁
从一月开始的短时间内，同京桥区新凑町的和田重雄以通信方式学习和歌。十月，全家搬到下谷区上野西黑门町二十番地居住。
1885年（明治十八年） 十三岁
在松永政爱家遇到十八岁的涩谷三郎，二人开始了长达五年的交往。涩谷是父母的乡党前辈真下专之丞的妻妾所生之孙，在东京专门学校攻读法律。
1886年（明治十九年） 十四岁
八月，在父亲的旧识远田澄庵的介绍下到中岛歌子的歌塾获之舍中学习和歌。荻之舍位于小石川安腾坂，虽说是民间歌塾，但荻之舍汇集了很多名门闺秀，例如乙骨牧子、田边花圃、伊东夏子等才媛。
1887年（明治二十年） 十五岁
一月，开始书写最初的日记《旧衣》。六月，父亲从警视厅退职，长兄泉太郎没有实现去关西赴任的愿望而回到东京，在大藏省出纳局配赋课谋得一个职位。十二月，泉太郎因肺结核不幸病殁。
1888年（明治二十一年） 十六岁
二月，一叶正式成为樋口家的户主。五月，又搬到芝区高轮北町十九番地。父亲变卖居所，倾尽家财，在私交甚好的松岗德善资助下投资运输承包生意。九月，再次搬家到神田区表神保町二番地，父亲在神田锦町拥有一家事务所。
1889年（明治二十二年） 十七岁
三月，父亲经商失败，举家搬迁至神田淡路町。七月，父亲病故，父亲生前曾希冀涩谷三郎同女儿完婚，以此照料妻儿的日后生活。九月，一叶带母亲妹妹投靠位于芝区西应寺町六十番地的虎之助。涩谷得知樋口家破产的消息后，单方面悔婚。
1890年（明治二十三年） 十八岁
一月，母亲同虎之助的关系恶化，矛盾无法调和，中岛歌子知晓情况后从五月开始，将樋口一叶接入歌塾居住，并令其担任女学校的老师来负担母女三人的生计。九月，又借住于义兄长十郎邻近的本乡区菊坂町七十番地，一叶一家靠针织缝纫和浆洗衣物维持生计。
1891年（明治二十四年） 十九岁
一月，荻之舍的姐弟田边花圃凭借作品《数之莺》作为新晋女流作家崭露头角，樋口一叶受此启发立志以文养家，开始执笔写作《一株枯萎的芒草》。四月，经妹妹邦子的友人野野宫菊子介绍结识了《朝日新闻》的记者半井桃水，桃水收一叶为徒并指导其写作。桃水当时三十二岁，妻子去世后一直独身，照顾自己的弟弟妹妹。
1892年（明治二十五年） 二十岁
三月，桃水的友人和弟子创办了同人杂志《武藏野》，一叶在其主持的杂志上发表了处女作《暗樱》，自己的文字第一次印成铅字。四月，发表《玉举》。五月，又搬到西邻的菊坂町六九番地。六月，一叶同桃水的绯闻在荻之舍愈演愈烈，迫于世俗压力，忍痛与半井断绝师徒关系，但桃水依然在金钱上资助一叶。七月，在《武藏野》发表《五月雨》。八月，在坪内逍遥、高田早苗的介绍下，在新潟三条町区裁判所担任检察官的涩谷三郎突然来访，表示愿意同一叶完婚。十月，《经案》在甲府的《甲阳新报》上连载。十一月，《埋没》开始在一流文学杂志《都之花》上连载，十二月完结。十二月，在桃水的资助下，在单行本《胡砂风吹》上发表一首和歌。
1893年（明治二十六年） 二十一岁
二月，在《都之花》上连载《晓月夜》。三月，《雪天》刊载在透谷、藤村等人创办的《文学界》，《文学界》的同人平田秃木来访。七月，因生计所迫，一叶一家搬家到下谷龙泉寺町三六八番地的一家三户连檐房中，俗称大音寺前（现东京都下谷区），毗邻吉原的游郭花街。八月，开了一间售卖粗点心和针线玩具的杂货铺。十二月，《琴音》刊登在《文学界》。
1894年（明治二十七年） 二十二岁
二月，开始同占卜师兼投资商佐贺义孝周旋，此时在《文学界》发表作品《隐身花丛中》。三月，一叶向佐贺义孝提出了物质资助，想借一笔钱作为本金，佐贺义孝为与一叶幽会，欲借钱给一叶。他露骨地要求收一叶为妾，遭一叶愤慨地回绝。在平田秃木的带领下拜访了马场孤蝶，二人成为知己。四月《花笼》在《文学界》发表。五月，本乡区丸山福山町四番地搬家，成为荻之舍的一名助教，从友人处借钱，并与佐贺义孝维持着艰难的交往。七月，在《文学界》发表《暗夜》，十一月完结。八月，藤村初次访问一叶。十二月，《大年夜》在文学界发表。
1895年（明治二十八年） 二十三岁
一月，《青梅竹马》在《文学界》开始断续连载，翌年一月完结。三月，从砚友社的作家大桥乙羽的信件中投稿给《文艺俱乐部》。四月，《檐前月》发表于《每日读卖》。五月，《行云》发表于《太阳》，上田敏、川上眉山初次探访一叶。六月，修补旧作《经案》于《文艺俱乐部》。八月《空蝉》发表于《读卖新闻》，每月附上随笔《雨夜》《月夜》；《浊流》发表于《文艺俱乐部》，在当时掀起了一股“一叶风潮”。十月，《大雁》《虫音》发表于《读卖新闻》。十二月，《十三夜》和修改后的旧作《暗夜》发表于《文艺俱乐部》。在这被和田芳惠称为“奇迹的十四月”，一叶留下了多篇深刻反映社会真实场景的优秀作品，轰动当时的日本文坛。
1896年（明治二十九年） 二十四岁
一月，《吾子》发表于《日本乃家庭》，《岔路》发表于《国民之友》。二月，《里紫》发表于《新文坛》。四月，《青梅竹马》于《文艺俱乐部》发表，《清醒草》在《三人冗语》合评中得到森鸥外、幸田露伴和斋藤绿雨的强烈赞赏，一叶因此被赋予“真正的诗人”的称号。此时一叶的肺结核已严重恶化。五月，《通俗书简文》通过博文馆发行，《自焚》于《文艺俱乐部》发表。绿雨初次访问一叶。七月，三木竹二同幸田露伴来访，将随笔《杜鹃》发表于《文艺俱乐部》。八月，身患重病的一叶无法继续写作，将旧作和歌八首发表于《智德会杂志》，经过山龙堂病院长的亲自诊断，宣告令人绝望的消息。秋季，斋藤绿雨和森鸥外商议，邀请青山胤通前来诊断，一叶此时已危在旦夕。
十一月，前往彦根中学赴任的马场孤蝶来到病榻前探视；二十三日午前，一叶因奔马肺结核过世，死时年仅二十四岁。二十四日，绿雨，川上眉山、户川秋骨守夜；二十五日，冷清的葬礼在妹妹的主持下举行，仅有十余名亲友参加。樋口一叶埋葬于筑地本愿寺境内的樋口家墓地，残存下未完的日记、随想以及四千余首和歌。