当“圣经密码”被提出来之后，不只是在宗教界引起了一片研究热潮，更在科学界成为一种现象级的事件。在研究“圣经密码”的科学家里面，最大名鼎鼎的非牛顿莫属了。
牛顿是一个伟大的科学家和数学家，他发现了万有引力定律，并创造了微积分，对于后世科学的发展作出了非常巨大的贡献。但却少有人知道，牛顿著作的60%都是有关于神学的，并且他还是一个在宗教学和占星术方面有着深厚造诣的学者。牛顿用了一生中大部分的时间来研究“圣经密码”，他认为《圣经》不只是一个宗教中的经书，其中还暗含着对人类文明发展轨迹的探测。也正是这些“密码”，铸就了后世人类命运的变迁。
因而在晚年时期，牛顿开始致力于“圣经密码”的研究与破解。他从整本《圣经》开始着手，试图从中找到隐藏的“密码”。甚至于直到他临终前，仍在孜孜不倦地探求着《圣经》中的小细节。有传言说，牛顿其实已经解读出了很大一部分的内容，但在他死后，所有的研究成果都神秘消失了。也有人说，是牛顿在临死之前托人把自己的手稿全部焚毁了。
而在最近的调研中，有人却提出了相反的结论。此结论指出，牛顿的手稿其实并没有被完全烧掉。在当今耶路撒冷的希伯来民族文化博物馆中还残留着牛顿的一部分手稿。经研究发现，这些都是牛顿在晚年时期留下的论文。而那一时期的牛顿，已经将全部精力放在神学研究上了，因而完全可以通过简单的推论得出这些论文全都是有关于神学研究的结论。
再仔细看论文的内容就会发现，牛顿在论文中正在试图用十分复杂的计算公式来推算并破译“圣经密码”。在这套复杂的公式背后，在最后一张字迹潦草的纸上赫然写着2060年。如果牛顿的计算没有出错的话，他从“圣经密码”中推断出来的世界末日应该是定在2060年。
同时，牛顿还预言，世界末日将会随着瘟疫和战争而来，圣人将会再次降临地球，而他本是历史上的圣人之一。
在2060年到来之前，没有人敢判断牛顿得出来的这一结论究竟是否正确。而今天大家公认的唯一一件事情是，牛顿预言中的圣人虽然不知道是谁，但他已然成为历史中的圣人之一。
美国曾有人同样痴迷于“圣经密码”，当他把牛顿的名字“Newton”放在万有引力“Gravity”这个单词旁边的时候，神奇的化学反应出现了。这两个词组刚一接触到，旁边就出现了另一组词“Bible Code Newton”，意为“圣经密码牛顿”。这是不是意味着，牛顿发现万有引力也是从“圣经密码”中寻到的结论呢？或者说，牛顿对《圣经》的研究，早就被“圣经密码”计算在内了。
如此神奇的事情，在历史的长河中，并不是单独的案例。