1944年8月4日上午十点到十点半之间，一辆汽车在普林森运河街二百六十三号停下。出现了几个人：一名身穿制服的党卫军军士卡尔·约瑟夫·西尔伯鲍尔和至少三名荷兰治安警察，身穿便服，携带武器。一定有人暗中告密。
他们逮捕了藏在后屋的八名成员，连同两位帮助者维克多·库格勒和约翰尼·克雷曼——但没有逮捕米普·吉斯和伊丽莎白（贝普）·沃斯库吉尔——并带走了他们在后屋所能找到的一切贵重物品和现金。
库格勒和克雷曼在逮捕之后被带到阿姆斯特丹的一所监狱。1944年9月11日，未经审讯，他们就被转送到阿姆斯弗特（荷兰）的一所集中营。克雷曼因健康状况不佳在1944年9月18日被释放，在阿姆斯特丹一直待到1959年去世。
库格勒得以在1945年3月28日逃脱，当时他和监狱中的其他人正在被送往德国服劳役。他于1955年移民加拿大，1989年在多伦多去世。
伊丽莎白（贝普）·沃斯库吉尔1983年在阿姆斯特丹去世。
米普·吉斯仍住在阿姆斯特丹，她丈夫让于1993年去世。
后屋的八位居民在被捕后先被送往阿姆斯特丹的一所监狱，之后转送到维斯特博克，荷兰北部的犹太人中继站。1944年9月3日，他们随同最后一批离开维斯特博克的犹太人，三天之后到达奥斯维辛（波兰）。
赫尔曼·范·佩尔斯（范丹），据奥托·弗兰克的证实，于1944年10月或11月在奥斯维辛被毒气毒死。
奥古斯塔·范·佩斯（佩特罗内拉·范丹）被从奥斯维辛遣往伯根·贝尔森，又从那遣往布痕瓦尔德，之后在1945年4月9日被送往特兰西恩市，显然在这之后又被送往另一个集中营。很肯定她没有生还，但死亡日期不得而知。
彼得·范·佩尔斯（范丹）被迫加入1945年1月16日从奥斯维辛去往毛特豪森（奥地利）的“死亡行军”， 1945年5月5日在那儿丧生，离集中营解放只有三天。
弗里茨·普费弗尔（阿尔贝特·杜赛尔）被从布痕瓦尔德或萨克森豪森转到诺恩加梅集中营，于1944年12月20日在此逝世。
埃迪特·弗兰克1945年1月6日在奥斯维辛-比尔克瑙因饥饿和劳累去世。
玛戈特和安妮在10月底被从奥斯维辛转往伯根-贝尔森，位于汉诺威（德国）附近的一个集中营。1944—1945年冬，那里爆发了一场伤寒，由于卫生条件极其恶劣，上千名囚犯死去，包括玛戈特，几天之后，安妮也去世了。她应该死于2月末或3月初。两位女孩的尸体很可能被埋在伯根-贝尔森的乱葬冈。这个集中营于1945年4月12日被英国军队解放。
奥托·弗兰克是八名藏匿者中唯一从集中营幸存下来的人。奥斯维辛被俄军解放之后，他途经奥德赛和马赛返回阿姆斯特丹。他于1945年6月3日抵达阿姆斯特丹，在那儿一直待到1953年，之后搬到巴塞尔（瑞士），和他姐姐一家及后来的兄弟住在一起。他后来与来自维也纳的埃尔夫丽德·马克维茨·盖林格结了婚，后者也是奥斯维辛的幸存者，丈夫和儿子均死于毛特豪森。奥托·弗兰克在1980年8月19日去世之前，一直住在巴塞尔附近的比斯费登，在那儿致力于向全世界传播他女儿日记中的信息。