根据《中国历史地图集》的东晋图，今江苏的江淮之间(应为徐州范围)，却注出幽、兖、青三州，徐州治所一向都在今徐州市或其以东等地，这时南迁到今扬州市范围内。幽、兖、青三州本在今河北、山东境内，一部分军民南撤后也在这里暂住，后来北方势力进一步南侵，徐州又由今扬州迁到京口(今镇江市内)，后来南方北伐，徐州又逐步北移到今徐州，其治所暂驻各点，一般叫做“寄治”。彭城(今徐州)与京口两处，称为徐州的时间较长，不过，在彭城的有时加“北”字，在京口的有时加上“南”字。
东晋和南朝为了安置大量南迁的难民，在南方新设了一些郡县，有的即以侨民原来籍贯命名，大部分在长江南岸，以今南京即当时的东晋首都建康的附近最为集中，有的并无实土，只管人群。后来实行“土断”，即以土地定户籍，使外来人口皆在所居郡县编著户口并纳税服役，才使社会较为安定。当时侨县名称保留至今的以安徽的当涂比较著名，当涂县原属扬州淮南郡，在今蚌埠市西南，以其北有涂山得名，涂山即传说中的禹会诸侯的地方，东晋时侨置当涂县与淮南郡于江南。今为安徽马鞍山市的属县。
侨州郡县虽为流民的迁移而设立，这是原因之一，但更与军力的转移有关，如西晋时兖州治所原在今山东郓城西北，郗鉴(晋朝人，明帝时拜为车骑将军，都督徐青兖三州军事，后辅成帝，晋太尉)改镇邹山(在今山东邹县)，这里也是兖州刺史驻处，后来撤到广陵(今扬州)，广陵也就成为兖州治所。兖州原在北方，而以广陵为中心的兖州，则是侨治。
在东晋的政区中，州、郡、县三级都有实与侨两种区分。以后宋、齐、梁、陈沿袭此制。可以说，这一时期是我国历史上地名非常混乱的时期。直到隋朝统一才得到有效的清理。