欧洲司令部（EUCOM）负责包括51个国家的地理区域。如上所述，非洲司令部的建立解除了欧洲司令部对于非洲大陆国家的职责。在苏联解体之后，欧洲司令部承担了对格鲁吉亚、亚美尼亚和阿塞拜疆的职责。它还负责以色列。
欧洲司令部总部设在斯图加特，是两个前沿部署区域作战司令部之一；它有5个成员司令部，人员超过9.4万（包括超过7.3万名军人和2万多名文职人员）：美国海军欧洲和非洲部队（位于那不勒斯的海军支援设施基地）、美国陆军欧洲和非洲部队（德国威斯巴登）、美国空军欧洲和非洲部队（德国拉姆施泰因）、美国海军陆战队欧洲和非洲分部（斯图加特）以及美国欧洲和非洲特种作战司令部。欧洲司令部在战区还有21个基地或站点。
欧洲司令部的J2部门负责管理欧洲联合情报行动中心（Joint Intelligence Operations Center-Europe）。据欧洲司令部的一份情况说明称，该部门“专注于优先为司令官提供预警、情况分析、相关预测评估，以及有关行动的‘动态安全’和方向战略的战略性内容”。这份情报说明还称，J2部门“平衡了战区战略决策者和行动司令官的需求”。如图6.4所示的组织架构图，欧洲联合情报行动中心的关键部门包括计划、行动和人力情报部和反情报部。
图6.4 欧洲司令部联合情报行动中心（JIOCEUR）组织机构图
司令部的分析性情报编制是“联合分析中心”（Joint Analysis Center）的职责，位于莫尔斯沃斯（后搬迁至布劳登英国皇家空军基地），直属于J2部门。联合分析中心的职能包括：
●战区范围的全源分析和评估；
●搜集管理；
●多资源情报处理、开发利用和分送；
●迹象和预警支持；
●目标情报支持；
●支持北约多国部队和美国联合特遣部队；
●情报成品的分发。
联合分析中心编制的报告包括：战区当前情报摘要；战区的区域评估；电子、空气、防御导弹和地面战斗序列；专题报告；迹象和预警报告；反恐、反情报和禁毒事件报告；演习分析和支持。
2005年3月，欧洲司令部司令官詹姆斯·L·琼斯将军（James L.Jones）对国会某个委员会说，欧洲司令部“为巴尔干半岛的维和行动、美国在高加索的决策者提供了支持，并为非洲的危机应对和反恐行动提供了支持”。此外，琼斯说，欧洲司令部“以反恐分析的形式支持了全球反恐战争，并将近乎四分之一的分析员临时部署到伊拉克和阿富汗”。
欧洲司令部包含了两个主要的处：支持处和情报处。如图6.5所示，情报处有5个下属部门：反恐（IDX）、欧洲/黎凡特（IDE）、欧亚大陆（IDR）、地理空间情报（IDG）和行动感知（IDO）。
图6.5 欧洲司令部联合分析中心组织架构