四平失守之后，毛泽东命令林彪：“长春卫戍部队应立即开始布置守城作战，准备独立坚守一个月，不靠主力援助，现时我主力则将在敌人两侧及远后方行动。”毛泽东不是不知道大平原上的长春不利防守，也不是不知道我军已消耗很大，疲惫不堪。这种考虑仍是从当时国共两党正在进行的谈判这个大局出发的。
就在四平之战之前不久的4月下旬，苏军已完全撤回苏联，东北的接收问题已不存在，存在的只是国共双方如何划分在东北所占地域的问题，双方如果再打，当然就是纯粹的内战。周恩来多次向马歇尔和蒋介石谈判东北的停火问题。这时中原并未怎么打，马歇尔还想暂时把内战控制下来，所以也劝蒋介石停火。他甚至表示，如果再不停火，他就退出调处回美国。这时，中国民主同盟提出了一个折中方案，就是共产党的军队退出长春，国民党军队也不进入长春，在这种情况下再行谈判全面停火。可是蒋介石非但不停火，反而在四平大打一仗。这时，毛泽东估计在我方和美方的压力下，停火有一定可能。如果我们能守住长春，就可能在停火时多占有一片地区，就可以在谈判中用退出长春来交换其他条件。
但是，事态的发展出乎毛泽东的预料。杜聿明在攻下四平之后，就命令部队继续前进，直指长春。杜聿明的考虑是，一则共产党发动群众、扩充队伍的速度很快，如果不很快攻占长春，东北民主联军很快就会有强大的兵力来守卫长春；二则东北最大的水电站小丰满电站就在长春附近，如不控制在手，整个东北包括沈阳在内用电就无法保证。本来这时蒋介石是没有命令杜聿明立即进攻长春的，在沈阳督促战事的国民党军队总参谋长白崇禧也认为打长春把握不大，但杜聿明认为有把握，从而说服了白崇禧，这才指挥着军队向北推进。是不是完全有把握，杜聿明心中并不是真正有底。可就在这时，出现了一个突发事件——我军在东北解放战争期间出现的最严重的一次叛徒事件，即王继芳的叛变。
王继芳是一个参加过长征的老干部，这时担任东北民主联军总部的作战科长。5月19日，当我军撤出四平之际，他叛变革命，当了叛徒。
由于他原来所担任的重要职务，了解我军大量的机密，故而他的叛变给我军的行动造成了十分严重的后果（王继芳叛变后进了军统特务系统，四川解放后在重庆被捕，被送到当时第四野战军总部所在地武汉市枪毙）。
杜聿明从王继芳那里得知了我军各部减员的情况和已经决定向北撤的部署之后，下定了向北进攻的决心，命令新六军等部以汽车坦克急速向长春一线推进，并宣布首先进入长春的部队赏东北流通券100万元。
这时我军主力都已投入到四平之战，长春的兵力不多。在四平之战后，我军主力消耗很大，有的部队在激战中已经分散，在向长春转移时，天上有敌军飞机的轰炸，地上有敌军机械化部队不时的攻击，速度不可能快。长春周围是一马平川，无险可守，兵力少了是无法守住的。
根据这种实际情况，东北局为了保存实力，避免无价值的牺牲，做出了退出长春的决定。
1946年5月23日，国民党军队占领长春。杜聿明本想继续向北进攻拿下哈尔滨，但他却在松花江南岸停了下来，让我军得以沿松花江为界暂获休整。杜聿明所以会停下来，是由于以下两方面的原因。
第一，蒋介石为一时的胜利冲昏了头脑，就在国民党军队进入长春的那一天，他偕同夫人宋美龄，在白崇禧等大员的陪同下，飞到沈阳视察，30日又飞往长春视察。他一来，大小头目都得陪同或等候召唤，各路军事行动只得一概停止。
第二，为了缓解北满方面的压力，中央军委和东北民主联军总部命令我南满地区部队在本溪地区寻机歼敌。我辽东军区部队在萧华的指挥下从5月15日开始行动，发起了鞍海战役。5月22日，我四纵收复鞍山。
在我方的军事压力和政治争取下，海城守军在潘朔端师长带领下于5月30日宣布起义。6月3日，我军又攻占了大石桥。整个鞍海战役共歼敌3300余人，争取起义2700余人。特别是潘朔端的起义是东北第一次整师起义，也是东北战场上我军第一次吃掉一个整师的战例，对东北战场战局影响很大。
由于国民党军队已经占领了长春，控制了大半个东北。所以，蒋介石于6月3日飞返南京之后第三天，在和马歇尔商议之后，宣布停战15天，以便在下一步的谈判中取得主动，在全国人民面前捞取政治资本。
同时也是为了休整部队，准备更大的进攻。
停战期间，国共代表又进行和谈。种种情况表明，和谈进入了关键时期。如果这次和谈破裂，国共两党之间的和谈很可能彻底破裂，内战将全面拉开。6月18日，蒋介石通过马歇尔向中共代表团提出《东北整军及中共军队在关内外划地驻留之方案》，他要占领包括哈尔滨在内的大部分地区，我党只能在佳木斯和齐齐哈尔地区活动。我党当然不可能接受这种条件。不能和平解决问题，就得准备大打。1946年6月19日，中共中央就向全党发出了准备大打的指示。6月22日，又给东北局专门发出了类似的指示。6月24日，林彪给中共中央发了一份长电，报告东北如果要大打将会遇到的困难，认为“目前能争取和平为有利”，为此，可以“作暂时的一定限度的让步”。6月25日，中央给林彪本人发出了“国民党一切布置是打，暂时无和平希望”，“全国大打”，“全靠自力更生”的指示。
中央的估计是正确的。6月26日，蒋介石就开始全面进攻我中原解放区，全面内战爆发。7月2日，周恩来和蒋介石进行会谈，毫无结果。
国共两党进行了大半年的和平谈判从此停止，此后再也没有进行过正式会谈。虽然周恩来仍在国统区与各界人士进行联络，做各方面的统战工作，还与美方多次讨论过停战问题，但国共和谈实际上已经彻底破裂（周恩来等在11月19日返回延安，参加军事调停处执行部的叶剑英等人则一直到1947年2月21日才回到延安），全面内战已不可避免。
全面内战开始后，从全国来看，由原来的“关外大打，关内小打”，变为“关外小打，关内大打”，因为蒋介石把内战的重点放在中原、陕北和山东。东北地区大致保持了以松花江为界的对峙局面。由此，我东北局把主要力量放到了根据地建设上来。