1941年11月11日，山本五十六率宇垣缠、黑岛龟人等主要幕僚，乘火车离开东京前往位于山口县的岩国航空大队。在那里，他们登上了前来迎接的“长门”号战列舰。此前，已经有不少海军舰船陆陆续续来到这里。小小的岩国航空大队刹那间将星云集，阴云密布。
11月13日上午9时，联合舰队在岩国航空大队举行了开战之前最后一次作战会议。会议结束之后，有一张合影照片幸运地保留下来。虽然不太清晰，还是依稀能够看出那些重要人物的面孔。照片的排次如下。
第一排都是司令长官：联合舰队山本五十六居中，左右一字排开第一舰队高须四郎、第二舰队近藤信竹、第三舰队高桥伊望、第四舰队井上成美、第五舰队细萱戊子郎、第六舰队清水光美、第一航空舰队南云忠一、第十一航空舰队塚原二四三。
第二排全是参谋长：联合舰队宇垣缠、第一舰队小林谦五、第二舰队白石万隆、第三舰队中村俊久、第四舰队矢野加志三、第五舰队中泽佑、第六舰队三户寿、第一航空舰队草鹿龙之介、第十一航空舰队大西泷治郎。
第三排的人大部分面生，是以联合舰队首席参谋黑岛龟人为首的各舰队首席参谋，分别对应为石塚千俊、柳泽藏之助、矢牧章、川井岩、宫崎俊、松村翠、大石保、高桥千隼。除了松村翠和大石保为中佐之外，其余都是大佐。
从名单能看出，除了小泽治三郎的南遣舰队（并不隶属于联合舰队）外，准备参加南方作战以及袭击珍珠港的各舰队司令长官、参谋长、首席参谋均到场了。
由于是战前最后的动员会，会议气氛略显紧张和悲壮。就当前形势来看，日本与美、英、荷开战已不可避免。这一天的会议结束之后，在场所有人都将奔赴各自战场，其中一些人可能不会再回来。
山本首先发言，他以最高指挥官的身份做了训话，表明了自己亲临战场的决心。“诸君，未来的希望就寄托在各位身上了。此行不论成功与否，大日本帝国和天皇陛下都会将诸位铭记在心。我热切地盼望各位奋勇作战，杀敌立功，奏凯而归！但愿全军将士与本人同生共死！”
之后山本突然宣布了一道匪夷所思的命令：“如果目前正在华盛顿进行的日美会谈达成协议，那么在开战之日前一天凌晨1时以前，将命令撤回已经出动的部队。所有部队接到命令后，必须立即掉头无条件返回。”
立即有人提出了异议。第一个发言的竟然是原本战意不足的机动部队指挥官南云忠一：“已经出发的舰队还要返航吗？这个要求不尽合理，将使我们陷入被动挨打的不利局面，也势必影响广大官兵的士气。”
马上有人开始附和：“司令长官，事实上这是一种不切实际的要求，射出去的箭难道还能收回来吗？”
接下来的话就显得有点粗鲁：“这简直是让活人把撒出去的尿再憋回来！”
山本马上一挥手，厉声呵斥：“养兵千日，目的不是为了战争，而是要保卫国家的安全和维护和平。如果在座哪位认为无法执行上述命令，请于此时此刻立即递交辞呈。”
担任联合舰队司令长官两年多以来，还从没有人看到过山本发如此大的火。与会者面面相觑，噤若寒蝉。当然更不会有人真去写辞职书。
看到众人的情绪逐渐平息，山本随即放缓了语气对大家说：“很好！诸位都是大日本帝国海军的精英，都知道誓死服从、效忠天皇陛下的命令。请各舰队按照原定计划做好战斗准备。另外我特别要求，准备参加袭击珍珠港作战的所有舰艇，必须卸下与作战无关的任何东西。由于集结地和所经路线的气候寒冷，各飞机副翼、方向舵、升降舵上都必须涂上防冻油脂。”
从11月16日开始，所有参加偷袭珍珠港作战的舰只以“木户部队”为代号开始严格实施无线电静默，以不规则的时间间隔，取不同航线分批驶向北方的集结地。
11月17日早晨7时，“长门”号在没有护航的情况下缓缓驶出了岩国口，于13时40分驶抵佐伯湾。15时，山本登上了南云机动部队的旗舰“赤城”号，向即将出征的将士做最后的激励和告别。山本向列队站在“赤城”号甲板上的约100位各级指挥官做出了最后的训话：
“如果不得已开战，那么这次行动就是要在开战之初进攻远在珍珠港方面的美太平洋舰队主力，作战的成败将决定帝国的命运。”
尽管依然那样精悍，山本也显示出悲壮的神色。他在对美开战问题上持反对意见，又是袭击珍珠港的积极倡议者。正因为他充分了解美国的强大实力，才主张必须首先攻击太平洋舰队。在世纪之初那场与俄国人的大海战中，初出茅庐的少尉候补生山本身负重伤。如今作为日本海军的最高指挥官，他将率领联合舰队在辽阔的太平洋上同美国一决雌雄。山本心里明白，即使袭击珍珠港能够取得成功，也只是暂时在太平洋战局中争得主动，把战争时间拖得更长，最终日本仍无法逃脱失败的命运。眼前的这些忠勇之士连同他自己，都将在这场战争中失去生命。
“这次作战要在排除一切困难和出敌不意的情况下进行，作战计划正是基于这种思想制订出来的。但是要知道，美国太平洋舰队司令官金梅尔将军是一个具有远见卓识的杰出人士，他非常小心谨慎。因此可以猜想得出，对于将要发生的一切事态，他可能早已采取了周密的戒备措施，各位将士务必做好充分的思想准备。要想到这次作战将是一场硬仗，切勿掉以轻心。帝国的生死存亡全拜托诸位了！”
有着“黄金假面”之称的宇垣缠尽管在很多时间里都无所事事，却有一个写日记的好习惯，他的日记《战藻录》成为战后研究太平洋战争的重要文献。当天晚上，宇垣在日记中如此写道：“山本司令长官的讲话甚为殷切，真是主将之言，感人肺腑。虽然将士们的脸上流露出某种吃惊的神色，但看来一般都很沉着，大家都已下定决心尽忠报国。尽管不能不预想到此举将会有若干牺牲，但愿神明保佑将能达到其目的。”
出征将士一个个血脉偾张，牙齿咬得咯咯直响。他们紧握双拳，激动的心情导致额头青筋突突跳动，肌肉的痉挛使得面部表情极端可怖。山本突然走到飞行队长行列跟前，默默地同渊田握手。两个人都一言不发：山本凝望着渊田，眼神中流露出无限的期望和绝对的信赖，渊田则以必胜和誓死相报的目光回答了山本。
与此同时，在吴军港水交社的一个房间里，特种潜艇攻击队的官兵正聚精会神地举行出击前的最后一次碰头会。山本派参谋有马少佐出席了会议。有马再次向特别攻击队指挥官佐佐木半九大佐传达了山本的指示：“特种潜艇不必强行进入珍珠港内。必须在营救官兵方面能够采取有效措施，确保官兵能够顺利返回的情况下才能实施攻击。”特种潜艇的参战官兵流着热泪纷纷写下决心书，委托有马转呈山本。
海军大尉岩佐直治：“尽忠报国。”
海军中尉横山正治：“断然行之，虽鬼神亦避之。”
海军中尉古野繁实：“沉着、勇敢、果断。”
海军少尉广尾彰：“七生报国。”
海军少尉酒卷和男：“细心大胆。”
为了尽可能隐蔽行踪，参加南云机动部队的众多舰艇，都是以不同日期分批从自己的锚地向着集结地单冠湾进发的。在参战舰只一艘艘拔锚起航的时候，联合舰队的其他舰只则实施无线电佯动进行掩护。集结行动极为隐秘，各舰只有舰长一人才知道此行的目的地。
11月18日夜，南云的旗舰“赤城”号开始出发前往集结地。航母上实行了严格的灯火管制。夜幕下，“赤城”号悄悄地由丰后水道南下。在福岛县盐屋崎附近，“赤城”号全部舰载机从母舰起飞，进行了最后一次实战训练。11月21日，“赤城”号在驱逐舰的引导下缓缓驶入了单冠湾。
第二航空战队“苍龙”号和“飞龙”号航母于11月18日12时，第八战队重巡洋舰“利根”号和“筑摩”号于14时，分别驶离佐伯湾。19日上午9时15分，行进到伊势湾海面上的“苍龙”号、“飞龙”号、“利根”号、“筑摩”号所有舰上人员列队在飞行甲板上，向着伊势神宫遥遥祭拜，祈祷日本武运长久。当天傍晚驶过东京湾海面时，秋雨淅淅沥沥，大家冒雨向皇宫遥拜。此行可能一去不返，众人只能以这种方式向裕仁做最后的告别。
11月18日傍晚，从馆山湾出发的快速战列舰“比叡”号和17日从佐世保港出发的快速战列舰“雾岛”号，也在东京湾外会合后一起向着单冠湾驶去。第五航空战队航母“翔鹤”号和“瑞鹤”号也于19日凌晨零时从别府起航。
8艘主力舰中，独缺第一航空战队的航母“加贺”号。它另有特殊任务需要执行，那就是去运载舰队翘首以盼的改装浅水鱼雷。三菱兵器制作所加班加点连夜制作，到11月10日，仅仅完成了28条鱼雷的改造。载有12架没有装弹鱼雷机的“加贺”号，也只能先从佐伯港赶到佐世保，停在工厂门口等待正在改造的鱼雷上船。到了11月18日，剩下那12条鱼雷的改造还是没有完成。眼看赶不上集结的时间了，实在没办法的“加贺”号只能把待改造的鱼雷、配件、工人和技术人员一起拉上，在海上边走边改。总算在出发前一天，也就是11月25日，如愿拿到最后改造好的12条浅水鱼雷。
随着最后一艘大型战舰“加贺”号的到来，南云率领的以6艘航空母舰为基干力量的约30艘水面舰船，已在北方荒凉的单冠湾集结完毕。
40条鱼雷算是有了着落，没想到炸弹又出了问题。水平轰炸机队使用的800公斤穿甲弹是用战列舰406毫米炮弹临时改造的。炸弹倒是赶制出来了，但机动部队快要集中的时候才发现，水平轰炸机原来的投弹装置根本装不上这种炸弹。还是老办法，让工人上舰，在机动部队驶往单冠湾的途中完成了投弹装置的改造。
所有参战舰艇上的私人物品以及不必要的设备全被留下，换上来的是一桶桶的燃油。通常当某个舰队离开日本时，舰上装的一般是适合炎热气候所穿的衣服，以及适合在南方气候条件下食用的特制食品。这次意外，除了那些物品，官兵还带上在寒冷气候下生存所需的特殊物品，如棉衣、防冻油、特种炮衣和其他防冷设备等。除了极少数人，大部分人不知道带这些玩意儿究竟要干什么。一些自以为聪明的水兵猜测，此行有可能到北方去进攻俄国人。但马上有人提出疑问，那也不用连夏季的服装和设备都带上啊？
就在南云机动部队陆续向着单冠湾集结的时候，11月21日下午4时，福留繁亲自登上停泊在广岛湾柱岛的“长门”号，向山本面交了于当日下达的《大海令》。
《大海令》第五号
兹奉敕命令联合舰队山本五十六司令长官：
一、联合舰队司令长官应命令必要部队，为进行作战及时向待命的海面进发。
二、联合舰队司令长官于进行作战准备过程中，若遇到美国、英国或荷兰军队之挑衅，需行使武力进行自卫。
三、有关具体事项，听候军令部总长指示。
军令部总长永野修身
昭和十六年十一月二十一日
山本根据上述指示以及同时下达的《大海令》第六号，于11月22日凌晨零时用电报下达了《联合舰队作战电令第五号》。根据这一电报命令，南云机动部队按预定计划于11月26日从单冠湾出击，向夏威夷远征。电报仍附有那个特殊条件：“根据形势变化，或者日美谈判获得成功，作战部队须根据命令立即集中返回驻地。”
千岛群岛中的国后岛横卧在南北狭长的日本列岛北端，同北海道东面的根室仅仅相隔一条海峡。由于一年中大部分时间都是烟雾蒙蒙，因此俄国人将这一片岛屿称为“烟雾列岛”，日本人则称为“千岛群岛”，以示其由无数小岛组成。其北侧国后水道对面的择捉岛是千岛群岛中最大的岛屿。该岛形状狭长，从东北向西南延伸。岛上只有一个小小的村庄、一个不大的水泥码头、一个邮局和一个无线电台。单冠湾位于择捉岛中部南岸，那里港湾水深，夏季浪涛汹涌，冬季却风平浪静。海湾内有两个渔港，位于外部的叫年萌港，靠里面的叫天宁港。平时只有在渔汛季节，渔船才会到这里集中和分散，因此外人几乎不知道这两个渔港的名字。它们只不过是日本北方普通的荒凉港口。正由于此，这里就成了南云机动部队最理想的集结地。
荒凉的择捉岛尚不能自给自足，它需要靠班船从根室运来粮食。现在这里既然成了南云机动部队的集结地，那些班船肯定是不能来了。为了保障在此期间岛民的正常生活，海军专门派来了补给船，给岛民运来粮食和其他生活必需品。为安全起见，那艘来自大凑警备府的“国后”号海防艇已提前来到单冠湾，关闭了镇上的无线电台和邮局，扣压了岛上所有外发的书信和电报，同时那些在单冠湾捕鱼的渔民也不许出海打鱼或者离开。——真不错，不用干活就有人管吃管喝了。
根据命令，机动部队从这里出发后，所有被扣留的渔船以及补给船还有“国后”号海防艇将继续留在此处，执行和此前一样的任务。这些措施要一直持续到12月8日正式开战后才解除。
千岛群岛的冬天来得很早，11月间就开始飘起漫漫飞雪。在漫长的冬季，整个岛上都覆盖着皑皑冰雪，静谧中透出一种祥和。已经习惯了平静生活的岛民，在这年冬天忽然发现了一件不同寻常的大事，一支庞大的舰队浩浩荡荡地开进了荒凉的单冠湾：一艘、两艘、三艘，数量还在不断增多。岛民织田浩二的小儿子一溜烟似的跑上了山坡，一五一十地数了一遍——大小舰艇有30艘之多，其中竟然还有之前只听说而未曾见过的巨无霸战列舰和航空母舰。
“出什么事啦？”
“一定是要演习啦。”
“胡扯，我们家在这儿生活了几代人，从来没有见过什么海军来这里演习，肯定是要打仗了。”
岛民议论纷纷之际，11月23日13时30分，第二潜艇部队担任警戒的三艘潜艇驶入港内，至此，机动部队所有参战舰艇全部集结完毕。这是自对马海战之后日本海军最大的一次集结。
机动部队的组成和指挥官——
总指挥：南云忠一。
参谋长：草鹿龙之介。
海上空袭部队：司令官南云忠一。
第一航空战队：航母“赤城”号、“加贺”号，司令官南云忠一。
第二航空战队：航母“苍龙”号、“飞龙”号，司令官山口多闻。
第五航空战队：航母“翔鹤”号、“瑞鹤”号，司令官原忠一。
海上支援部队——
指挥官：三川军一。
第三战队：高速战列舰“比叡”号、“雾岛”号，司令官三川军一。
第五战队：重巡洋舰“利根”号、“筑摩”号，司令官阿部弘毅。
海上警戒部队——
指挥官：大森仙太郎少将。
轻巡洋舰“阿武隈”号，驱逐舰“谷风”号、“浦风”号、“滨风”号、“矶风”号、“不知火”号、“霞”号、“霰”号、“阳炎”号、“秋云”号。
先遣巡逻队——
指挥官：今泉喜次郎大佐。
潜艇“伊-19”“伊-21”“伊-23”。
海上补给部队——
指挥官：大藤正知大佐、新美和贵大佐。
加油舰“极东丸”“健洋丸”“国洋丸”“神国丸”“极洋丸”“东邦丸”“东荣丸”“日本丸”。
参与珍珠港作战但没有来到单冠湾集结的还有4支部队，出发地是位于加罗林群岛的特鲁克基地。
先遣编队——
指挥官：第六舰队司令官清水光美。
第一潜艇部队：佐藤勉少将率领“伊-9”“伊-15”“伊-17”“伊-25”4艘潜艇在瓦胡岛东北展开，攻击美军可能出动反击的舰艇。
第二潜艇部队：山崎重晖少将率领“伊-1”“伊-2”“伊-3”“伊-4”“伊-5”“伊-6”和“伊-7”7艘潜艇在瓦胡岛与考爱岛、莫洛凯岛之间的考爱海峡、卡伊威海峡展开，监视并伺机攻击美军。
第三潜艇部队：三轮茂义少将率领“伊-8”“伊-68”“伊-69”“伊-70”“伊-71”“伊-72”“伊-73”“伊-74”“伊-75”9艘潜艇在瓦胡岛以南海域展开，攻击美军可能出动反击的舰艇。
特别攻击部队——
指挥官：第三潜艇大队司令佐佐木半九。下辖“伊-16”“伊-18”“伊-20”“伊-22”和“伊-24”号5艘潜艇，各携带一艘袖珍潜艇，在空袭前将袖珍潜艇放出，由其自行潜入港内，在第一次空袭开始后乘乱从水下发射鱼雷实施攻击。
要地侦察部队——
“伊-10”号负责侦察南方斐济、萨摩亚群岛方面，“伊-26”号负责侦察北方阿留申群岛美军的动向。
中途岛破袭部队——
指挥官：第七驱逐舰大队小西要人海军大佐，由“曙”号、“涟”号两艘驱逐舰和“尻矢”号补给舰组成，任务是炮击中途岛，策应主力舰队在珍珠港的作战。
山本讲完话，握完手，拍拍屁股走了，千钧重担就完全落在南云肩上。他率领的这支舰队是日本联合舰队的精华，麾下官兵总计超过15000人。
在“二战”太平洋战场，要说对日本海军的影响之大，应该说南云仅仅排名在山本之后。按官职来说，尽管在山本战死之后，接任联合舰队司令长官的古贺峰一、丰田副武、小泽治三郎都比南云高，但影响力均不及南云。究其原因，在于不管是日本海军大胜的珍珠港还是大败的中途岛，南云都是战场的第一指挥官，真可谓“成也南云，败也南云”。
肤色浅黑、身材瘦削的南云，1887年3月出生于山形县，比山本小3岁，江田岛海军兵学校第三十六期毕业，在同期191人中成绩排第七位。之后先后两次进入海军大学深造，毕业后又在多艘驱逐舰、巡洋舰、战列舰上服役，练就了一身过硬的水上本领。南云还担任过水雷学校和海军大学的校长，是日本海军中赫赫有名的鱼雷战专家。1935年晋升少将，1939年晋中将，其间参加过中日淞沪会战。就在太平洋战争打响前，1941年4月，南云临危受命，出任第一航空舰队司令官。从那一刻起，他就清楚，其个人荣辱成败，从此与日本的命运紧紧联系在一起。
佐官时代的南云曾经锋芒毕露，言辞和行动在日本海军内部颇得赞誉。南云是不折不扣的“舰队派”，当年因和“条约派”的井上成美发生争执，拔出军刀要活劈了井上。而如今，沉重的心理压力使他逐渐变得畏畏缩缩，被大家戏称为“沉默寡言的海军提督”——这对于日本海军以及南云本人，都不能不说是一种悲哀。虽然话语不多，但性格暴躁的南云，其军事谋略往往咄咄逼人却缺乏创见，有时甚至是考虑不周。从战争前期南云参与的那几场惊世骇俗的大海战中，我们可以看出，南云不管是战前计划的制订以及战中战机的把握，都没有积极地明示过个人意图。
水雷专家南云对航空作战纯粹外行。战后有评论家说，如果南云不是指挥第一航空舰队，而是指挥由战列舰组成的第一舰队，或者以重巡洋舰为核心的第二舰队，可能更符合他的习惯个性。换言之，南云并不是指挥大型航母舰队的最佳人选。历史就是如此地阴错阳差，鱼雷战专家南云意外地坐上了航母舰队司令官的位置。老酒以为，担任这一重要职务的第一人选，当属熟悉航空作战、智勇双全且与陆军能够良好合作的南遣舰队司令官小泽治三郎。第二人选才是第二航空战队司令官、航空战专家山口多闻。之所以将山口排在小泽之后，是因为老酒觉得，山口和第三航空战队司令官角田觉治一样，勇猛有余，稳健不足，是将才而非帅才也。本来还有一个人选，那就是第十一航空舰队司令官塚原二四三。但这家伙侵华战争期间在武汉被炸成重伤，失去了左手，被认为不再适合在海上服役，因此只好在岸上待着了。
南云是现实中的悲观派，因此，联合舰队才特意安排草鹿来给他当参谋长。一方面，草鹿还算知道点航空战，可以在工作中弥补南云的不足。另一方面，草鹿是天生的乐天派，与悲观的南云在性格上可以互补。相对于南云司令官的满脸愁云，草鹿整天嘻嘻哈哈，乐个不停，好像什么事都不放在心上。
但如果就此认为南云是无能之辈，就大错特错了。南云有短板，也自有长处，水雷战专家肯定也是航海专家。正当大家为如何隐秘远航6000公里不被发现而坐卧不安时，南云顺利地将庞大的机动部队带到了指定的攻击地点，中途没出现任何闪失，珍珠港能够取得“大胜”，南云可以说厥功至伟。珍珠港之战后，南云的知名度直逼山本。此后半年，他率领那支无敌舰队东挡西杀，南征北战，展开了一系列杀鸡用牛刀的战役，且战必胜、攻必克，所向披靡，打得美、英、荷这现在或曾经的世界海军老大望风而逃。一时间，盟军谈“南云”色变，这种状况一直持续到中途岛之战爆发。
11月23日上午9时，南云召集各战队指挥官、参谋人员到旗舰“赤城”号商讨作战有关事宜。参加会议的除了南云，还有一位中将，他就是此时还在跑龙套，今后在萨沃岛海战中给美军带来最大耻辱的海上支援部队司令官三川军一。此外，还有草鹿龙之介、山口多闻、阿部弘毅、原忠一、大森仙太郎一班少将，以及源田实、大石保等一群牛人。会议将对舰队行走路线、海上加油、巡逻和警戒、舰载机起飞时间和地点等重大问题进行通盘研究。
第一是需要确定行走路线。会议决定按照之前黑岛龟人的设计，走风大浪急、气候恶劣的北线。尽管此线会给海上加油带来一些困难，但是，隐藏行踪，不被提前发现，更为重要。况且加油方面的困难通过自己努力是可以克服的。
当初“Z计划”在军令部等待审批时就有人提出，何不趁此机会对珍珠港实施两栖登陆，一举攻占美国在太平洋上的最大军事基地呢？老酒年轻时也曾经很天真地多次思考过这个问题，事实上这一异想天开的建议当时很快就被否决。美军在珍珠港的陆军部队有步兵第二十四师、第二十五师和海岸炮兵、陆军航空兵等共42959人，加上海军陆战队等海军部队，总兵力应该不会少于50000人。这样强大的一支地面力量，日军至少要登陆3个以上陆军师团才可能取胜。人员、弹药、补给将需要多少运兵船哪？南方战役还打不打？最重要的是，如果真那么做，就肯定不能走波涛汹涌的北线，如此庞大的舰队根本不可能走完中航线或者南航线而不被发现。
第二是海上加油。会议初步确定了几次加油的大致时间和海域。万一海上加油无法进行时，就让必须加油的警戒部队返航，由机动部队主力单独冲锋陷阵，设法将飞机平安无事地运抵起飞地点是机动部队压倒一切的任务。
第三是确定起飞地点。距离珍珠港太近容易被美军发现，太远又会导致飞行员在过于疲劳的状态下投入战斗，影响鱼雷和炸弹的命中率，缺乏海上飞行经验的战斗机要单独返航也将更加困难。会议最后决定，起飞海域为瓦胡岛以北370公里，即北纬42°、西经170°附近海域。
根据当时日军飞机的速度推算，从飞机起飞在航母上空编队集合，到飞抵攻击目标约需2个小时。日本还拟利用所谓“不等航程”进攻法得利，就是航空母舰摸黑航行，黎明时分开到最接近袭击目标的地点时飞机起飞，随后航空母舰往回驶离，飞机返程在起飞地点较远的地方与航空母舰会合。日机航程去时较短，返回时比去时长一些。这样，一旦美机进行追击，就必须在一往一返上飞行更远的距离，增加其追击的难度。可惜美军被打晕了，根本无力组织反击，这一精心策划后来没派上用场。
第四是确定攻击方向。在冬季大部分时间里，信风都是从东北方向徐徐吹向瓦胡岛中部的库埃牢山脉，在那里形成密集的云雨层，这就为偷袭提供了极好的掩护。突击机群可以隐藏在云雨层里面悄悄接近目标，然后在防卫者能够起飞截击之前突然出现在珍珠港上空。9年前，亚纳尔上将率领的美国机群，也正是从这个方向突入港口的。
最后的问题是搜索和警戒。这一任务交给了“伊-19”“伊-21”和“伊-23”3艘潜艇，它们将在机动部队前方约370公里处形成一道警戒线。另外，战列舰“比叡”号、“雾岛”号和重巡洋舰“利根”号、“筑摩”号搭载的水上侦察机，也将在机动部队周围约300公里范围内实施搜索和警戒。
会议结束时已经是16时，那边一个同样重要的会议还没有结束。如果说刚才这一群人都是浮在海上，那么，那一群人就全是飞在天上的。
相比那一群将官来说，这边不过是一群佐官和尉官而已，但会议的内容同样重要。会议主持人是第一波攻击机群的指挥官渊田美津雄，其余还包括鱼雷机队长村田重治、俯冲轰炸机队长高桥赫、战斗机队长板谷茂、第二波攻击负责人岛崎重和及诸多飞行队长等。他们中的大部分人都是第一次听到偷袭珍珠港计划。
会议首先要确定进攻时间。最初计划是在拂晓时发起攻击，为此各飞行队需要在夜间从航空母舰起飞，进行大编队夜间飞行。这对于第一和第二航空战队的老鸟不成问题，但对第五航空战队的各飞行队来说，就勉为其难了，他们还没有进行过几次这样的训练，到时候能不能飞起来都成问题。因此会议决定，改为拂晓时起飞实施白昼攻击，即在日出前一小时，大约早上6时，舰载机从航空母舰起飞。
其次是各飞行队攻击目标的次序。就目前掌握的情报来看，珍珠港内有航母三、四艘，战列舰8艘。首选攻击目标当然是航母，其次是战列舰，最后依次是重巡洋舰、轻巡洋舰、驱逐舰和其他舰只，说白了就是按照个子大小排着炸。
要干掉美军大部分主力舰只，使得太平洋舰队在半年乃至更长时间里失去作战能力绝非易事。如果是海上作战，可以一举把敌舰击沉，使之彻底沉入深海。但是目前敌舰队停在修理设施完备的军港里，那里水深只有10多米，如果敌舰吃水7米，只要下沉不到10米，就会接触海底。敌舰“沉没”后，如果倾斜不厉害，舱面甲板也许还沾不到海水，用不着花多大力气就可以打捞上来重新修复使用，因此，必须想办法把它们彻底炸毁才行。这就需要对不同方式的攻击效果进行预测。
第一是鱼雷攻击。鱼雷机队一共40架飞机，使用的鱼雷重800公斤，其中炸药量约200公斤。要使一艘战列舰或航空母舰这样的大型舰只受到致命打击，至少需要命中3条鱼雷，以便破坏它的水下部分使之倾覆。有的鱼雷机可能被美军高射炮火击落，充其量能达到60%的命中率，即有24条鱼雷命中敌舰。以一艘舰需要命中3条鱼雷计算，只要目标分配得当，可以击沉敌主力舰8艘。鱼雷机队的40架飞机共分为8个中队，其中4个六机编队和4个四机编队，每个中队选定一个攻击目标，这样鱼雷机队就安排了对4艘航空母舰和4艘位于外侧战列舰的攻击。
第二是水平轰炸。水平轰炸机队共计50架飞机，以五机编队编成10个中队，投弹高度是3000米。水平轰炸效率较差，轰炸程序也非常死板。实施水平轰炸时，五机编队各机之间要保持半架飞机的距离，以等高度和等航速组成严整的队形。向导轰炸机的驾驶员需要有高超的技巧来及时修正航向，不能有丝毫偏差。编队由向导轰炸机的投弹瞄准手引导，在接近目标时一起投弹。后续轰炸机必须在向导轰炸机投弹的一刹那拉动投弹索，第二架和第三架轰炸机的投弹时间不得迟于向导轰炸机投弹时间的1/100秒，第四架和第五架则不得迟于1/10秒。这样才能使炸弹的落点覆盖目标，其中大致可以有1颗炸弹命中，即以五机编队为一个攻击单位时，5颗炸弹有1颗命中。但10个攻击单位并不一定都能捕捉到目标，在攻击中也会受到相当损失，大致上能保持80%的捕捉率，即只有8个攻击单位中的8颗炸弹命中目标。
水平轰炸使用的是战列舰406毫米炮弹改装的800公斤穿甲炸弹，一旦命中就足以致命。这种炸弹装有延迟时间为0.2秒的延期引信，能够穿透战列舰的装甲在舰内爆炸，一旦在弹药舱附近爆炸就会引起连环大爆炸，效果最佳。后来“亚利桑那”号战列舰就真应了日军的判断。
要使一艘战列舰受到致命打击，大体需要命中2颗800公斤炸弹，就是说水平轰炸机队发挥正常，可以搞掉4艘战列舰。美国太平洋舰队很可能是2艘战列舰并排停泊在福特岛东岸右侧，而鱼雷机队是无法对停在内侧的战列舰实施攻击的，所以排在内侧的4艘战列舰正好留给水平轰炸机队去对付。
如果一切顺利，40架鱼雷机和50架水平轰炸机基本上可以给予美国太平洋舰队的主力——约12艘大型战舰致命打击。但这只是理论上的，实际上肯定会有偏差。没事，后边还有俯冲轰炸机在等着呢。
接下来就是俯冲轰炸。俯冲轰炸机队因为要做出一系列高难度动作，所以每架飞机只能携带1颗250公斤普通炸弹。俯冲轰炸机从4000米高度开始俯冲，为了获得较高命中率，当高度表的指针指到450米时开始投弹，在顺风条件下还可以加大俯冲角度，这样就可以把命中率提得更高，最终有望超过80%。但有的飞机可能被击落，预计可以保持50%的炸弹击中目标。俯冲轰炸机共81架，取其半数为40颗命中弹。不过250公斤炸弹不能穿透战列舰的装甲，即使命中，也无非擦伤而已。相对于战列舰来说，航空母舰的结构单薄，俯冲轰炸可以给予其致命打击。航空母舰是主要之敌，因此俯冲轰炸机将全力以赴攻击所有航空母舰。如果兵力有余，还将按战列舰、巡洋舰次序选择攻击目标。
战列舰以及航空母舰一旦遭到鱼雷攻击，就会倾覆，没有装甲的水下部分就将露出水面。这时再使用俯冲轰炸，就能把敌舰彻底炸毁，使之无法修复。对这样的目标，将由第二波攻击中的俯冲轰炸机队来完成。
最后该给战斗机派任务了。上述所有任务要想顺利完成，有一个前提，那就是必须取得作战区域的制空权。这些任务只能交给那些所向无敌的零式战斗机了。敌人的战斗机当然会伺机起飞，第一波制空战斗机队45架战斗机和第二波36架战斗机，将首先歼灭起飞的敌机，确保制空权，然后对各机场进行扫射。
除了舰船，还必须瘫痪美军在瓦胡岛上的六大机场。第一波俯冲轰炸机队54架飞机分为3队，将同时攻击驻有战斗机的惠勒机场及福特岛机场，以及驻有重型轰炸机的希卡姆机场。福特岛机场和希卡姆机场离珍珠港很近，攻击这两个机场时要求严格注意，不要让腾起的硝烟妨碍其他部队对珍珠港内舰船的攻击。
为了进一步扩大战果，第二波水平轰炸机队共54架飞机也分为3队，将继续对上述机场进行轰炸，为此第二波水平轰炸机队将搭配携带250公斤和60公斤炸弹。
以上是参加这次空袭的总共约360架飞机所分配的攻击目标。为了保卫机动部队自身的安全，每艘航空母舰将留下1/3的战斗机在舰队上空巡逻，避免突发事件的发生。
会议结束了，各项准备工作并没有结束，而是贯穿在整个航行过程当中。几乎每天突袭计划都在进行着细节的调整和修正，很多高级军官甚至片刻不离作战室，连晚上睡觉都是和衣而卧。不管谁想到一个问题，马上翻身而起，大家再一遍一遍地推敲和研究。
联合舰队早已将美国太平洋舰队的各种军舰模型下发到各飞行队，飞行员对美国舰船的识别也进行了不厌其烦的训练。他们利用训练间隙的宝贵时间，从舰艇的纵横面以及不同斜角进行观察，提高识别美国军舰的能力。譬如哪艘军舰有几个烟囱，舰桥在左舷还是右舷，是笼式桅还是三角桅，等等。飞行员连做梦都在琢磨，这使得他们对美国舰船特别是航母和战列舰等大型舰只的识别率几乎达到100%，远远超过对本国舰船的识别能力。
其间有这样一个小插曲。姊妹舰“瑞鹤”号和“翔鹤”号外形非常相似，一次演习结束时，“瑞鹤”号上的飞行员塚本祐造错误地降落在“翔鹤”号上。对此，塚本不好意思地自嘲：“要是美国的航空母舰，俺保准不会弄错哩！”惹得大伙哄堂大笑。
11月24日，南云召集所有飞行员到“赤城”号甲板上，进行了出征前最后一次训话。南云最后说：“如今国家正处于生死存亡之关头，若诸位置生命于度外，勇于肩负重任，愿以一片赤诚之心尽忠报国，愿以果敢勇猛精神闯过难关，天下任何事情均能办到。愿诸位忠勇之士与本职同心协力，慷慨捐躯，以报君恩！”
训话之后，由军令部铃木英——他刚从夏威夷实地考察回来，随“比叡”号战列舰到达单冠湾，在瓦胡岛的模型面前对珍珠港的情况再次进行详细说明。铃木说：
一、美国太平洋舰队的作战舰艇仍按以前的方式进行训练，逢星期一出港，最迟到星期六回港。
二、大型舰艇停泊地区都在瓦胡岛周围，战列舰成双并排停靠在一起。
三、航空母舰目前所在位置不明，但有两艘至三艘航空母舰在夏威夷附近水域游弋。
四、珍珠港港口没有敷设水雷，但估计其四周装置有完备的防潜网。
五、除了星期六下午和星期日以外，美军的飞行训练颇为活跃。
六、好像没有出动飞机进行大规模的空中巡逻。
七、除了11月7日发现在希卡姆航空基地大飞机库上空有两只直径为4.5米的黄色圆形气球和一只深绿色的固定气球外，未看到有阻塞气球。
八、瓦胡岛附近的气象情况是少雨，飞行方面没有困难。早晨瓦胡岛的群山之巅多半为云层覆盖，中午以前天气往往十分晴朗，但下午又有一点残云。
第二天，各飞行队长在所在航空母舰上分别按照攻击计划，向飞行员交代了各自的作战任务，之后参加袭击珍珠港的全体飞行人员以飞行队为单位，轮流来到“赤城”号作战室，参观瓦胡岛和珍珠港的沙盘模型。这个面积约3.3平方米的模型，是军令部此前为袭击珍珠港作战特地制作的。
总指挥官渊田站在模型旁边，用教鞭指示并说明地形和攻击要领。比如他对鱼雷机队飞行员讲解说：“鱼雷机队在这里接到攻击命令，就冲向山谷进入山坳，然后这样迂回过来，以50米高度通过工厂区的障碍物，就到岸边了。这同在鹿儿岛湾训练的要领一样。一飞到岸边，立刻把高度降到20米，然后马上投雷。这就是福特岛，目标可能并排靠在那里。要注意这段距离是500米，这里水深只有12米，就在这里实施我们苦练过的浅海鱼雷攻击。要特别留神，否则鱼雷会扎入海底。从先头中队开始依次从右向左攻击。不要只挑好打的目标而过分集中在一个地方，一个中队负责攻击一艘军舰。”
从早到晚，渊田连续讲解了20多次。从鱼雷机队、水平轰炸机队、俯冲轰炸机队到制空战斗机队，都对照沙盘充分交代了各自的任务。到了晚上，渊田的嗓子都哑了。
在袭击珍珠港胜利返航后，一个飞行员谈到这次袭击的感受时告诉渊田：“队长，瓦胡岛的地形跟咱们的沙盘简直是一模一样的呀。”闻听此言，大家禁不住哈哈大笑。
早在11月19日，特别攻击队的5艘潜艇各运载1艘特种潜艇，已经沿着四国和九州之间的丰后水道南下，向着珍珠港以北的指定地点悄悄驶去。