在前文中，我们说过，法医病理学还有一门分支，叫“法医组织病理学”。那么，相对于我们花了大篇幅介绍的法医病理学，什么才是法医组织病理学呢？法医病理学是运用临床病理学的技术方法，对死者的组织器官进行镜下检验。主要运用于死因不明、伤病关系分析的案件中。有的时候也会利用法医组织病理学对一些尸体现象、生前死后伤的诊断等发挥作用。
我们在介绍死因的时候，说过什么是直接死因，什么是间接死因，什么是联合死因，什么是诱因。其实这些概念的意思，就是要研究伤与伤、病与病或者伤与病，究竟哪一个才是导致死亡的最主要的因素。
在很多案件中，死者并没有机械性窒息的征象，也没有致命性的机械性损伤，那么这种死亡，通常是内因（疾病）引起的。但是死者的家属可不这样认为，一般猝死的人，所患的疾病都是潜在性的。也就是说，在死者生前，并不一定表现出来，体检也可能检不出来，其家属也并不一定知道他患有这种潜在性疾病。那么，法医要证明死者是内在潜在性疾病导致死亡，就一定要拿出证据。这些疾病，通常是不能被肉眼所发现的，那么怎么获取这样的证据呢？法医组织病理学会帮助法医解决了这个问题。
比如，一起案件中，双方当事人在简单肢体接触后，就有一方突然倒地死亡。显然外伤不足以致死，那么就要通过法医组织病理学对死者的内脏器官进行检验，确定死者的猝死缘于何种疾病，从而界定行为人应负的责任。如果死者是患有潜在性的心脏疾病，那么说明行为人和死者发生纠纷这一行为，诱发了死者潜在的心脏病突然发作，导致死亡。行为人的行为只是死亡的诱因，一般不能按照故意伤害致死定罪，那么根据具体案情的不同，按照过失致人死亡定罪，或者只负责民事赔偿责任。
那么，法医组织病理学是怎么开展的呢？显然用法医现场勘查箱里的那点儿玩意，是不可能解决这一高科技问题的。
之前，我们介绍过尸检的程序。如果法医在尸体检验的时候，发现外界因素并不能导致死者死亡，并且通过毒物化验，确定死者并不是死于中毒，那么法医就要决定对尸体进行组织病理性检验。这样，法医会通过尸检工作，逐个或者整套取下尸体的全套内脏器官，比如：心、肝、脑、肺、肾、脾、胰腺、甲状腺、肾上腺等等。当然，取下的脏器，如果不妥善处理，不仅会腐败，而且会组织自溶。所以，法医会立即将取下的内脏放置在一个桶里，桶里装着准备好的福尔马林溶液，这样的工序，会把组织固定，防止组织的腐败和自溶。
固定后的组织，会变成灰褐色，质硬。总之，和学校生物实验室里瓶瓶罐罐里泡着的差不多。固定完成后，法医会对器官进行观察，然后在一些常规的部位或者怀疑有问题的部位进行取材。也就是把那些部位切成小块状或者小条状，这一步工序，叫作取材。取材也是比较辛苦的工作之一。因为组织器官经过福尔马林的浸泡，充满了刺眼冲鼻的味道，而在这种工作环境里，法医还需要仔细认真地发现、辨别可能有异常的组织部位进行取材。但取材毕竟只取一小部分，所以如果取不到异常部位，那么所有的后续工作都是白费，最后的观察检测也不可能发现异常。
取材后，为了防止组织器官细胞死亡后引发的水肿而影响镜下的观察，法医要对取下的检材进行“脱水”。这道工序是把组织器官里的水分都去掉，用的仪器设备是脱水机。
脱水完毕后，法医要进行“包埋”的工序。包埋的工具类似于大家冰箱里用于制作冰块的格子盒，法医将这些格子盒里装满加温融化的石蜡，然后将脱水后的检材放进去，等蜡凝固，检材就被石蜡包埋在里面，就像是琥珀一样。做好的蜡块就是一个一个小立方体，人体组织就在立方体的中间。这道工序，是为了方便下一步切片。
切片使用的仪器是切片机。切片机对一个法医很重要，别看只是个小小的机器，它能把蜡块中的组织切成很薄很薄的片。这些薄片薄到只有一层细胞，为了不出现在镜下多层细胞重叠并有碍观察的情况，必须要达到一定的标准。切下来的薄片，放在摊片机里，就会因为水的张力作用而张开，周边的蜡融化，只剩下一层薄薄的组织。切片和摊片是技术含量最高的两步工序，如果法医的技术好，则可以一次成功，如果技术不好，则要反复切、摊。当然，取下来的检材有限，所以也由不得法医不停地去切，所以技术好可以节省检材，以备今后复核检验。
法医这时候会拿着一张载玻片放进摊片机里，小心翼翼地把组织薄片放置在载玻片上，这一步要求组织片不能打皱或者重叠。把组织片成功地放置在载玻片上以后，法医就要进行最后一步工序——染色。因为未经染色的细胞没法在显微镜下进行观察，所以只有用一些特定的染色方法（常用的方法是HE染色），把细胞质和细胞核分别染色了，才能更清楚地观察细胞形态、分辨细胞种类，以及判断细胞是否正常。染色干燥后，在载玻片的中央组织片处，覆盖上一层盖玻片，就可以在显微镜下进行观察了。之前所有的工序，都是定式，只要学习操练过都可以进行。最难的一步，就是最后的阅片。必须具有大量组织病理学知识的法医，才能准确、客观地通过阅片而诊断出死者组织器官的异常情况，从而明确死因。就像是病人之前的挂号、分科、引导工作，都很简单，而最后的诊断则必须要由经验丰富的医生来进行。
有的时候，真相就在这一张张切片中，慢慢呈现。当然，法医组织病理学检验的意义，远远不止分辨伤病关系这么简单。有的时候，法医对于损伤的判断，甚至对于生前伤死后伤的分辨也要依靠法医组织病理学来进行。
【案例】某人在接受警方询问的时候，趁警察不注意，突然从窗户一跃而出，高坠死亡。但因为是在警务工作中突然死亡的案例，所以检察院介入了调查。经过检察院法医检验，认为死者确实符合高坠死亡的特征。家属为了索取赔偿，对这一结论并不满意，所以通过私人关系找到了某知名法医。令人意想不到的是，这名法医仅仅通过尸体照片，就判断死者手上的两个黑点是电流斑，从而枉言死者在生前遭受过警方电棍的电击。这一事件曾经在网络上引起轩然大波，两名民警也冤屈入狱。为了查清真相，相关部门组织法医专家，对死者手上的黑点进行了法医组织病理学检验。通过检验，确定这两处黑点只是生理特征，并没有电流通过的组织病理学特征，从而用确凿的证据证明了死者生前并没有遭受过刑讯逼供。这个故事告诉我们，法医组织病理学在很多时候会发挥重要作用。同时，这个故事也教育我们，凡事要以科学说话，要以证据说话，信口雌黄只会被别人用证据来猛扇耳光。