在日本的教育制度里，满6岁的小孩儿一般都会在当年4月进入小学。日本的义务教育年限和中国完全一样，也是6年小学、3年初中，在公立的小学和初中上学不需要交学费。另外，和幼儿园一样，绝大部分小学也是三学期的学制：4月到7月是第一学期，9月到12月是第二学期，1月到3月是第三学期，其中第一和第二学期之间有40天左右的暑假，第二和第三学期之间是两周的寒假，第三学期和接下来的第一学期之间还有10天的春假。日本法定的休息日是周六和周日。在日语里，周六写作“土曜日”，周日写作“日曜日”。此外，周一到周五分别叫作月曜日、火曜日、水曜日、木曜日、金曜日。
在日本的小学，1班、2班通常叫“1组”、“2组”，一个班的人数上限是40人，每个班都依据每个学生的性格特点和适应能力编成。如果一个年级有两个以上的班级，一般来说每隔两年就会进行一次大换班。教室配有黑板和桌椅，很多学校还会安装电视、放映机、暖气、空调等。校内一般还有展示学生作品的布告栏、供学生放置书包等个人用品的储物柜、广播设备等。日本小学的每个班级都会有一名“担任”老师，类似于班主任。除了音乐、图工以外，这名老师会负责绝大部分的课程教学。
日本小学的每个年级要学习的课程都由日本的《学校教育法》明文规定：一、二年级学习国语、算术、生活、音乐、图工、体育、道德课；三、四年级的学生则不上生活课，学习社会和理科课；五、六年级的学生在三、四年级的基础上新加家庭课。有些学校还会额外设置一门外语课程，一般是英语。有些课程的名称一看就明白，比如算术、音乐、体育；有些则不好理解，比如图工相当于中国的美术课。社会这门课的内容和中国的地理课有很多重叠的部分，主要讲日本的自然环境、地理构成、政治框架、经济生活等内容。理科和中文里的“理科”差不多，主要讲除数学以外的自然科学知识，物理、化学、生物、地理的内容都包含在其中。一、二年级的小学生学习的生活课实际上就是社会和理科这两门课的综合课程。
五、六年级的家庭课可能是日本独有的课程。这是一门动手课，学生们在课上学做针线活儿、煮鸡蛋、削苹果等，随着年级越高难度系数也越大。在老师的指导和带领下，学生们学习与生活相关的各种器具的使用方法，培养独立生活的能力。
道德课在日本有一段曲折的历史。“二战”前，道德课在日本叫修身课，是一门德育的课程，主要教导学生对国家、他人和个人的道德，具有一定的宗教色彩。“二战”结束后，GHQ把修身课认定为军国主义教育课程，强制废止了。20世纪50年代，日本社会兴起一股逆行“民主化、非军事化”的潮流，战前的德育课程也以“道德”的名义顺势复活。不过，现在日本的道德课并没有修身课中强烈的忠君爱国思想，主要是为了培养学生的公民道德素质。
在日本的义务教育阶段，所有课程中需要的教科书都由国家免费提供。这些教科书全部由民间出版社编写完成，通过国家审定合格之后就能供各学校选择使用。
小学四年级以上的学生可以参加学校的各种社团活动。社团活动是日本学生生涯中很重要的组成部分，从小学一直持续到大学。社团活动种类繁多，大体上可分为运动类和文化类两类。运动类包括棒球、足球、篮球、游泳、田径等国际通行体育项目，还有像相扑、柔道、剑道、弓道这样的日本传统武道，成绩优秀的学生甚至可以代表日本去参加奥运会。文化类的内容更加庞杂，有吹奏、美术、漫画、茶道、电影、舞蹈等偏艺术的，也有文学、外语、数学、历史等偏学术的，还有计算机、机器人、航空航天等偏技术的。整体上来说，日本丰富的社团活动是学生培养个人兴趣和一技之长的重要途径，也能给学生时代留下美好的回忆。不过由于社团种类和数量实在是太多，很多时候会发生有人明明在某个社团报了名却从来不去参加活动的情况，这种学生被称为“幽灵部员”。
进入小学之后，不管是学生还是家长，可参加的活动种类都比幼儿园增加不少。日本小学的运动会分春季和秋季两种，分别在5月和9月举行，全校分为红、白两组进行对抗。为什么要分成红组和白组呢？“红白”一说最早见于平安时代的源平合战。由于源氏用红旗，平氏用白旗，从此红、白两色就被用作对抗的颜色，比如被不少人称为“日本春晚”的NHK的“红白歌合战”。在运动会上，红、白两组学生会通过徒步竞走、障碍物竞走、投篮、接力传递等进行团体竞技。运动会当天，家长们会带着便当来为自家的小孩儿加油打气。这是一段家长和孩子都能尽情享受的日子。
还有一个活动叫新春试笔大会。这是日本人在新年第一次用毛笔写字或作画的传统活动，一般在每年的1月2日举行。小学生们由于要过寒假，只能等到第三学期开始后的1月中旬再参加。每个年级的学生都会被布置不同的主题，比如“今年的抱负”这样符合新年新气象的主题。低年级的学生由于还不太会写字，大多会使用比较粗的尖头万能笔，高年级则用普通的笔就行。每次新春试笔大会都会选出金奖、银奖等，获奖的作品会在学校的布告栏中展出。
日本小学生的一天从早上起床开始，刷牙洗脸之后和家人一起吃完早餐就得赶去学校了。和幼儿园不一样，上小学之后就必须自己去学校。上学分为结队上学和单独上学两种。结队上学指的是开学之前，学校或PTA在不同的地区划分好“上学班”，每天早上，当地的上学班以集体移动的方式去上学。一般来说，上学班的孩子都会在当地的公园一角或是某个公寓门前提前集合，到了出发时间就由年纪最大的那名学生举着小黄旗带领大家一起去学校。单独上学就是自己约上附近的好友一起上学的情况。如果周围没有去同一所学校的同龄人，家长也可以拜托住在附近的高年级孩子带着去。日本的小学生在上学途中会背一种硬式的皮制双肩包。虽然没有硬性规定，但一般来说男生背黑色的，女生背红色的。这种显眼的双肩包几乎就是日本小学生的标志。
到学校之后，小学生们要先把鞋子收纳进玄关附近的鞋柜，换上学校统一的拖鞋。学生们到达教室之后首先进行早会。早会一般在第一节课开始前10分钟进行，由当天的值日生在黑板上写上当天日期，确认出席情况，然后带领大家做一些简单的游戏、测试。小学的课程一节有45分钟，一般从8点40分开始上第一节课，上午总共4节，然后是午餐时间，下午根据年级不同会上1节或2节。
日本小学生制服和背包
秋季西式校服（夏装为衬衫，冬装加西装外套）
西式校服：西装、衬衫、蝴蝶结、领带
校标：左胸口
裙子（女）：百褶裙（有些有格子花纹）
裤子（男）：西裤（有些有格子花纹）
袜子：常见的是黑色、白色、深蓝色
鞋：学生平底鞋
书包
小学生的书包几乎是同一款式。有很多种颜色可供选择，一般女孩子背红色系，男孩子背黑色系。书包材质通常为软牛皮，质量非常好。一般一个日本小学生的书包会从一年级入学开始，一直用到小学毕业
日本的公立小学一般都会提供午餐。每到午餐时间，班级的负责老师会和学生们一起在教室里用餐，校长一般也会邀请几位学生去校长室一起用餐。午餐的费用要由学生的家长承担一部分，虽然不同地方有不同的标准，但费用都在每月4000日元上下。这些食物都是在学校的食堂制作的，没有食堂的学校会由当地的伙食中心统一配送。无论哪种情况，每天的菜单都由专业的营养师依据不同年龄段儿童的需求精心计算搭配，既要考虑到营养健康，又不能让孩子们吃腻。
早在19世纪末，日本的部分学校已经开始尝试集体供餐了。当然，那时候的菜单都比较朴素，基本上就是饭团配腌菜。1940年后，随着日本越来越深地陷入“二战”的泥潭，绝大部分学校的集体供餐都中断了。1945年战争结束，日本才在美国的饮食援助下慢慢恢复了学校供餐。现在日本的学校伙食已经相当丰富全面，从和食到中餐再到西餐应有尽有。一般来说，主食会是米饭或面包，主菜和副菜各有一两道，副菜的其中一道必是甜品，还有就是每天必不可少的牛奶。
午餐过后是固定的大扫除时间，一般会持续20分钟左右。大扫除是全年级的活动，不同班级有不同的负责区域。学生们会拿着扫帚、毛巾等，在老师的统一调配下进行打扫。在日本，大扫除并不是安排给学生的工作，而是学校教育的一环。下午的课结束之后，老师会布置好家庭作业和明天需要带来学校的物品，学生做好笔记，收拾好东西之后就可以跟老师道别了。放学回家的方式也分结队和单独两种，不过高年级的学生可能要在学校进行社团活动，很多小学生会先在学校或家附近玩儿一阵子再回家。回家之后向家长汇报当天在学校的情况，然后吃晚饭、做作业等。
这便是日本小学生典型的一天。